Los principales favoritos de la Copa de la UEFA no han fallado y se han clasificado para la fase de grupos. A la cabeza de todos ellos el Milán, que venció por la mínima en Zürich, siguiendo con su progresión al alza durante los últimos partidos. Tampoco fallaron el City de Robinho, el Schalke, el Ajax o el Benfica de Quique Sánchez Flores.
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Los de Carlo Ancelotti ganaron por la mínima en Zürich en un encuentro que dominaron de principio a fin jugando con teóricos suplentes como Ronaldinho o Shevchenko, que fue precisamente el autor del gol de la victoria. Junto al Milán también se clasificaron los transalpinos de la Sampdoria y, el Udinese, que venció por penaltis al Borussia de Dortmund en uno de los duelos más interesantes de la jornada. Precisamente el Dortmund fue el único equipo alemán que cayó en esta primera fase ya que el Hertha Berlin, Stuttgart, Wolfsburgo, Hamburgo y el Schalke 04 -que eliminó el Atlético en la previa de la Champions- pasan a la fase de grupos.
Quique Sánchez Flores venció en su duelo al Nápoles, que presentó mucha más batalla en el partido de ida. José Antonio Reyes y Nuno Gomes marcaron los goles de la victoria lusa, que acaba con el sueño del humilde equipo italiano tras haber vencido en la ida por 3-2.
Tampoco faltarán en el bombo equipos ilustres como el Ajax de Amsterdam, el Rosenborg, el Galatasaray o el Spartak de Moscú, entrenado por Michael Laudrup. Las "grandes" sorpresas de la jornada fueron la derrota del Besiktas turco a manos del FC Metalist Kharkiv y la victoria del Standard de Lieja sobre el Everton de Mikel Arteta.
| IDA | VUELTA | ||
| 3-1 | Milan | Zúrich | 1-0 |
| 1-2 | Polit. Timisoara | Partizan Belgr. | 0-1 |
| 2-0 | Hertha Berlín | Saint Patrick | 0-0 |
| 0-1 | Baník | Spartak M. | 1-1 |
| 1-0 | Besiktas | Metalist Jarkiv | 1-4 |
| 2-0 | Portsmouth | Vitoria Guimar. | 2-2 |
| 1-2 | Kayserispor | PSG | 0-0 |
| 2-0 | Sevilla | Austria Salzburgo | 2-0 |
| 1-0 | Wolfsburgo | Rapid Bucarest | 1-1 |
| 0-1 | Marítimo | Valencia | 1-2 |
| 0-0 | Dinamo Zagreb | Sparta Praga | 3-3 |
| 1-2 | Omonia Nicosia | Manchester City | 1-2 |
| 2-2 | Young Boys | Brujas | 0-2 |
| 1-0 | Nancy | Motherwell | 2-0 |
| 2-2 | Everton | Standard Lieja | 1-2 |
| 3-2 | Nápoles | Benfica | 0-2 |
| 3-4 | Bellinzona | Galatasaray | 1-2 |
| 1-0 | NEC Nimega | Dinamo Bucar. | 0-0 |
| 1-0 | Racing | Honka Espoo | 1-0 |
| 1-4 | Apoel Nicosia | Schalke 04 | 1-1 |
| 1-3 | Litex Lovech | Aston Villa | 1-1 |
| 2-1 | Austria Viena | Lech Poznan | 1-2(4-2) |
| 1-1 | Vitoria Setúbal | Heerenveen | 2-5 |
| 2-0 | Brann Bergen | Deportivo | 0-2(3-2) |
| 0-0 | Slavia Praga | Vaslui | 1-1 |
| 1-2 | Slaven | CSKA Moscú | 0-1 |
| 1-2 | Brondby | Rosenborg | 2-3 |
| 1-2 | Cherno More | Stuttgart | 2-2 |
| 2-1 | Rennes | Twente | 0-1 |
| 1-4 | Borac Cacak | Ajax | 0-2 |
| 2-1 | Tottenham | Wisla Cracovia | 1-1 |
| 1-1 | Zilina | Levski S. | 1-0 |
| 0-2 | B. Dortmund | Udinese | 2-0(4-3) |
| 4-0 | S. Braga | Artmedia Petrzalka | 2-0 |
| 1-2 | Hapoel Tel Aviv | Saint Etienne | 1-2 |
| 0-2 | Nordsjalland | Olympiacos | 0-5 |
| 0-1 | Feyenoord | Kalmar | 2-1 |
| 5-0 | Sampdoria | FBK Kaunas | 2-1 |
| 0-0 | Hamburgo | Unirea Urziceni | 2-0 |
| 1-2 | Moscú | FC Copenhague | 1-1 |
